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y Massenspektrometrische Untersuchung pflanzenassoziierter mikrobieller Gemeinschaften

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Matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) time-of-flight (TOF) mass spectrometry (MS) is a unique tool for fast and high resolving characterization and identification of cultivable microorganisms. In this MS-based biotyping technique, the molecular mass of most abundant proteins in a crude extract is measured and the spectra information is used as a fingerprint for a particular organism.

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Die Matrix-unterstützte Laser-Desorptions-Ionisations-Flugzeit-Massenspektrometrie (MALDI-TOF MS) ist ein einzigartiges Instrument zur schnellen und hochauflösenden Charakterisierung und Identifizierung kultivierbarer Mikroorganismen. Bei dieser auf MS basierenden Biotypisierungstechnik wird die Molekülmasse der am häufigsten vorkommenden Proteine in einem Rohextrakt gemessen. Die Spektreninformationen werden daraufhin als Fingerabdruck für einen bestimmten Organismus verwendet. Das Verfahren wird zur schnellen Gruppierung von Bakterien- und Pilzisolaten, d. H. Dereplikation, angewendet, um in umfangreichen Screening-Kampagnen Mikroorganismen zu charakterisieren, die aus Pflanzen isoliert wurden. Durch die Schnelligkeit dieses Verfahrens kann eine hohe Anzahl von Isolaten untersucht werden, um ein genaues Bild der Biodiversität kultivierbarer Mikroorganismen zu erhalten. Aus Rhizosphären und Pflanzen gewonnene Isolate werden in Innokulationsversuchen auf ihre mögliche Verwendung zur nachhaltigen Steigerung der Pflanzenproduktion getestet.